1、如果初創公司很快要進行融資談判或有可能被大公司收購，應盡快申請專利，以證明自己的技術能力，增加談判砝碼。
2、選擇哪種方法和初創公司的行業（技術復雜程度，對生產工藝的要求）有很大關系，一般而言，如果競爭對手看著你的專利說明書就能把產品做得和你一樣好，甚至超過你，那就要考慮是申請專利，還是采用技術保密的方法。畢竟沒有企業想卷入專利侵權訴訟之中，而且即使打贏官司，市場已經被對方占據。反之，如果你的專利技術含量很高，對方無法模仿，那應該盡早申請。
3、如果你認為你的技術是“基礎性的”，發展前景大、能夠影響行業格局的、開發周期長、費用大、能夠不斷改進的，盡早申請專利。
4、如果你的技術很容易被“反向工程”（即從產品逆向分析及研究，從而演繹并得出該產品的處理流程、組織結構、功能性能規格等設計要素）的方法破解，那還是應該申請專利，因為商業秘密的保護方法無效。此時你雖然無法實質阻止對手使用你的技術（訴訟成本太高），但持有專利總是名正言順，在產品營銷方面也有好處。